Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms