Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms