Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarcc1P97496 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms