Protein–RNA interactions for Protein: P97433

Arhgef28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef28P97433 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Arhgef28P97433 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef28P97433 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms