Protein–RNA interactions for Protein: P84228

Hist1h3b, Histone H3.2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3bP84228 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h3bP84228 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h3bP84228 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h3bP84228 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h3bP84228 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h3bP84228 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h3bP84228 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h3bP84228 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h3bP84228 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h3bP84228 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h3bP84228 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h3bP84228 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h3bP84228 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hist1h3bP84228 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hist1h3bP84228 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms