Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx3P81067 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx3P81067 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx3P81067 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms