Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx2P81066 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx2P81066 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Irx2P81066 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms