Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Otx1P80205 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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