Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf11P70378 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms