Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad1P70340 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad1P70340 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad1P70340 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smad1P70340 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms