Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms