Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf5P70191 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf5P70191 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Traf5P70191 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf5P70191 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf5P70191 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms