Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms