Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps28P62858 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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