Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms