Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chp1P61022 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chp1P61022 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms