Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa1P58281 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa1P58281 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opa1P58281 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opa1P58281 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opa1P58281 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa1P58281 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opa1P58281 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms