Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bace1P56818 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bace1P56818 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bace1P56818 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms