Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms