Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckbrP56481 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckbrP56481 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CckbrP56481 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckbrP56481 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckbrP56481 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms