Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms