Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgd1P52734 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms