Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec1P51908 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms