Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LumP51885 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LumP51885 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LumP51885 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LumP51885 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LumP51885 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LumP51885 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LumP51885 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LumP51885 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LumP51885 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LumP51885 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LumP51885 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LumP51885 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LumP51885 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LumP51885 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LumP51885 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LumP51885 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LumP51885 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LumP51885 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LumP51885 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LumP51885 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LumP51885 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LumP51885 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LumP51885 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LumP51885 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LumP51885 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LumP51885 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LumP51885 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LumP51885 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LumP51885 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LumP51885 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LumP51885 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LumP51885 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LumP51885 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LumP51885 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LumP51885 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LumP51885 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LumP51885 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LumP51885 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LumP51885 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms