Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl9P51670 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl9P51670 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl9P51670 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl9P51670 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl9P51670 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl9P51670 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl9P51670 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl9P51670 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl9P51670 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl9P51670 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl9P51670 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl9P51670 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl9P51670 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccl9P51670 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl9P51670 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl9P51670 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl9P51670 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl9P51670 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccl9P51670 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl9P51670 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccl9P51670 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl9P51670 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl9P51670 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl9P51670 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl9P51670 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms