Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa8P50706 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa8P50706 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa8P50706 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa8P50706 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms