Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdhaP50136 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms