Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfaP48030 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfaP48030 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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