Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpiaP47968 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpiaP47968 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpiaP47968 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RpiaP47968 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RpiaP47968 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RpiaP47968 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RpiaP47968 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RpiaP47968 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RpiaP47968 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RpiaP47968 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RpiaP47968 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms