Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syt1P46096 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syt1P46096 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syt1P46096 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syt1P46096 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syt1P46096 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syt1P46096 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syt1P46096 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syt1P46096 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syt1P46096 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syt1P46096 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syt1P46096 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syt1P46096 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syt1P46096 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syt1P46096 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syt1P46096 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syt1P46096 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syt1P46096 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syt1P46096 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Syt1P46096 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms