Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlx1P43345 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms