Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms