Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rfc1P35601 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms