Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc10P31257 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxc10P31257 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxc10P31257 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxc10P31257 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc10P31257 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc10P31257 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc10P31257 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc10P31257 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms