Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa2P31245 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms