Protein–RNA interactions for Protein: P29478

SEC65, Signal recognition particle subunit SEC65, yeastyeast

Predictions only

Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC65P29478 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.83□□□□□ -2.54
SEC65P29478 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.83□□□□□ -2.54
SEC65P29478 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.83□□□□□ -2.54
SEC65P29478 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.86□□□□□ -2.55
SEC65P29478 snR77snR77 88 nt-0.87□□□□□ -2.55
SEC65P29478 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.93□□□□□ -2.56
SEC65P29478 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.03□□□□□ -2.57
SEC65P29478 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.09□□□□□ -2.58
SEC65P29478 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.1□□□□□ -2.59
SEC65P29478 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.21□□□□□ -2.6
SEC65P29478 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.23□□□□□ -2.61
SEC65P29478 snR6snR6 112 nt-1.39□□□□□ -2.63
SEC65P29478 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.4□□□□□ -2.63
SEC65P29478 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.42□□□□□ -2.64
SEC65P29478 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.43□□□□□ -2.64
SEC65P29478 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.45□□□□□ -2.64
SEC65P29478 YNR077CYNR077C 255 nt-1.49□□□□□ -2.65
SEC65P29478 snR73snR73 106 nt-1.61□□□□□ -2.67
SEC65P29478 YOR309CYOR309C 381 nt-1.63□□□□□ -2.67
SEC65P29478 snR40snR40 97 nt-1.81□□□□□ -2.7
SEC65P29478 snR75snR75 89 nt-1.96□□□□□ -2.72
SEC65P29478 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.02□□□□□ -2.73
SEC65P29478 snR58snR58 96 nt-2.13□□□□□ -2.75
SEC65P29478 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.33□□□□□ -2.78
SEC65P29478 snR87snR87 109 nt-2.48□□□□□ -2.81
SEC65P29478 YDR543CYDR543C 300 nt-2.83□□□□□ -2.86
SEC65P29478 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-3.41□□□□□ -2.96
SEC65P29478 YJR162CYJR162C 351 nt-3.7□□□□□ -3
SEC65P29478 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.95□□□□□ -3.04
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.2 ms