Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcdP28867 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms