Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp3P28862 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms