Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apex1P28352 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apex1P28352 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apex1P28352 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms