Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjc1P28229 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms