Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb9P28076 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms