Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms