Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd247P24161 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd247P24161 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd247P24161 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd247P24161 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd247P24161 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd247P24161 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms