Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gja1P23242 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms