Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms