Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.4 ms