Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prph2P15499 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms