Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd1P13516 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms