Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q1

Ccdc153, Coiled-coil domain-containing protein 153, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc153P0C7Q1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ccdc153P0C7Q1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ccdc153P0C7Q1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ccdc153P0C7Q1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ccdc153P0C7Q1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ccdc153P0C7Q1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ccdc153P0C7Q1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ccdc153P0C7Q1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ccdc153P0C7Q1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc153P0C7Q1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ccdc153P0C7Q1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ccdc153P0C7Q1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ccdc153P0C7Q1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Ccdc153P0C7Q1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc153P0C7Q1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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