Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb2P0C1T1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms